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儀器數(shù)據(jù)采集在LIMS建設過程中，主要目標是實現(xiàn)從LIMS中將樣品編號、檢驗檢測項目、方法等發(fā)送到儀器設備工作站，并從儀器設備工作站中將樣品編號，檢驗檢測項目、方法、結(jié)果，質(zhì)控結(jié)果等信息發(fā)送到LIMS中，從而實現(xiàn)雙方向的數(shù)據(jù)自動傳輸。儀器設備的數(shù)據(jù)采集是LIMS能夠極大提升檢驗檢測人員效率的功能，因此是否進行了儀器采集、儀器采集覆蓋實驗室的儀器數(shù)量、是否進行雙向傳輸?shù)冉?jīng)常作為LIMS提升效率的關鍵評判標準。
儀器數(shù)據(jù)采集概述
根據(jù)儀器是否具備雙向傳輸條件，將儀器數(shù)據(jù)采集劃分為雙向傳輸儀器數(shù)據(jù)采集和單向傳輸儀器數(shù)據(jù)采集。要實現(xiàn)雙向傳輸，主要有兩種方式一種是通過與網(wǎng)絡化色諧工作結(jié)（如：Empower、CDS等）集成進行雙向傳輸；另一種是直接通過僅器設備提供的接口協(xié)議進行數(shù)據(jù)傳輸。
根據(jù)儀器設備提供的數(shù)據(jù)傳給接口、工作站的情況等，將儀器數(shù)據(jù)采集劃分為串口數(shù)據(jù)采集、并口儀器數(shù)據(jù)采集、網(wǎng)口儀器數(shù)據(jù)采集、藍牙儀器數(shù)據(jù)采集、文件儀器數(shù)據(jù)采集等不同的種類，但是，在LIMS建設過程中，為了達到儀器接口的統(tǒng)一性，一般會輔以硬件資源。
將不同的接口轉(zhuǎn)化為統(tǒng)一的接口方式，例如，將串口、并口、藍牙等通過相應的轉(zhuǎn)換器直接轉(zhuǎn)換為統(tǒng)一的無線網(wǎng)絡傳輸，這樣在LlMS中只需要針對網(wǎng)絡傳輸協(xié)議進行數(shù)據(jù)處理即可。
需要說明的是，為使數(shù)據(jù)在儀器和LIMS之間傳輸，需要將儀器產(chǎn)生的數(shù)據(jù)上網(wǎng)，但是考慮到實驗室儀器直接接入互聯(lián)網(wǎng)會造成潛在的安全風險，所以僅將儀器接入安全的局域網(wǎng)，同時要保證，儀器聯(lián)網(wǎng)技術不能與儀器工作站的軟件產(chǎn)生沖突。
儀器采集4種方式
01串口輸入設備采集
宿主服務下達采集指令,采集端接收到消息指令通過串口采集設備檢測數(shù)據(jù)，并將接收到的會話編碼一并提交宿主服務或保存采集主控端數(shù)據(jù)庫。
系統(tǒng)通過指定的串口號、波特率、數(shù)據(jù)位、停止位、校驗位、數(shù)據(jù)類型實時監(jiān)聽串口變動，將監(jiān)聽的數(shù)據(jù)實時存在在系統(tǒng)緩存；
02.文件類輸出設備采集
檢測人員掃碼將樣品編碼輸入檢測設備工作站系統(tǒng)，當檢測完成后，采集端通過監(jiān)聽文件輸出實時解析檢測結(jié)果，并將檢測結(jié)果按照采集端報文格式保存到采集主控端數(shù)據(jù)庫。
03.數(shù)據(jù)庫類輸出設備采集
檢測人員掃碼將樣品編碼輸入檢測設備工作站系統(tǒng)，如果檢測設備支持寫入則宿主服務可以自動下發(fā)樣品編碼及相關數(shù)據(jù)。采集端定時檢查檢測設備工作站數(shù)據(jù)庫的輸出，獲取到檢測數(shù)據(jù)后按照采集端報文格式保存到采集主控端數(shù)據(jù)庫。
04.其他輸出設備采集
具體需要現(xiàn)場勘察調(diào)研而定。
采集工作站采集過程
1.所有數(shù)據(jù)統(tǒng)一存儲于單機數(shù)據(jù)庫, 關聯(lián)人、機、料、法、環(huán)等信息 (如: 生產(chǎn)設備、產(chǎn)品批次、測量儀器等)，不能通過網(wǎng)絡訪問，只能通過本機計算機訪問。后期也可作為LIMS系統(tǒng)質(zhì)量大數(shù)據(jù)平臺的數(shù)據(jù)采集端使用，保證客戶不會重復投入；
2.數(shù)據(jù)采集功能，數(shù)據(jù)采集工具將以客戶端的形式運行在與設備連接的工作站電腦上，主要負責將設備產(chǎn)生的完整的可輸出的原始結(jié)果提取到系統(tǒng)，供實驗室人員進行報告生成、匯總等操作；
3.儀器數(shù)據(jù)采集采用系統(tǒng)+ActiveMQ消息服務器客戶端的形式實現(xiàn)，數(shù)據(jù)采集分為兩部分，第一可將需要的樣本編號等信息以約定的形式發(fā)送給設備；
4.采集客戶端負責進行實際的采集行為的處理，并將采集后的結(jié)果以消息的形式返回。采集客戶端還負責將設備所需的項目編號等信息以約定的形式發(fā)送給設備；
5.采集時根據(jù)各設備情況可分為手動采集和自動采集，手動采集時由系統(tǒng)界面發(fā)起采集動作；
6.采集客戶端實時監(jiān)聽采集申請，客戶端收到采集申請后進行相應設備結(jié)果的數(shù)據(jù)采集然后以消息的形式返回給系統(tǒng)完成數(shù)據(jù)采集；
7.自動數(shù)據(jù)采集時由采集客戶端根據(jù)本地配置的采集規(guī)則進行定時的結(jié)果掃描并將需要的數(shù)據(jù)回發(fā)給LIMS系統(tǒng)；
8.實驗人員將分析儀器檢測結(jié)果文件（如PDF、word、Excel、CSV、TXT ） 等從數(shù)據(jù)工作站中導出，存放至指定目錄下；
9.LIMS系統(tǒng)或者開發(fā)的采集數(shù)據(jù)軟件定時掃描改文件夾，通過解析儀器的檢測結(jié)果文件的數(shù)據(jù)存儲格式，從文件中提取實驗室結(jié)果信息存儲至LIMS的檢測結(jié)果數(shù)據(jù)庫中。 
