煙草苗期病害主要有炭疽病、猝倒病、立枯病等。炭疽病在各煙區(qū)苗期發(fā)生最為普遍；猝倒病在我國(guó)南方煙區(qū)發(fā)生較重，北方煙區(qū)也有發(fā)生，由于目前集約化育苗方式的普及，該病危害呈現(xiàn)上升趨勢(shì)；立枯病在我國(guó)各煙區(qū)零星發(fā)生，個(gè)別管理不善的苗床發(fā)生較重；另外煙草花葉病在苗期發(fā)生也比較普遍，由于苗期一般不顯現(xiàn)癥狀，所以很難觀察到。其他零星發(fā)生危害的還有黑脛病、根黑腐病、白粉病、根結(jié)線蟲(chóng)病、野火病等。苗期害蟲(chóng)主要有地下害蟲(chóng)（螻蛄、地老虎、金針蟲(chóng)、蠐螬等）和蚜蟲(chóng)等。雖然目前苗床土多采用藥劑熏蒸，地下害蟲(chóng)危害不大。不過(guò)近年來(lái)蚜蟲(chóng)、斑潛蠅遷飛到苗床的數(shù)量越來(lái)越多，造成較大危害，應(yīng)當(dāng)重視苗期這兩種害蟲(chóng)的防治。

　　一、確保苗期衛(wèi)生  不可用污水育苗。管理人員操作前要用肥皂水洗手。每次剪葉前一天要噴施防病毒劑，剪葉、剪根的工具要用肥皂水或病毒抑制劑消毒。管理人員嚴(yán)禁在操作中吸煙。及時(shí)清除苗床周?chē)�作物植株殘�(bào)w和雜草，減少病蟲(chóng)害的滋生蔓延場(chǎng)所。

　　二、重視苗期管理  煙苗三葉期前少澆水，尤其在陰雨、低溫情況下更需控制苗床濕度，注意排水。濕度過(guò)大可撒干細(xì)土吸濕，加強(qiáng)苗床的通風(fēng)排濕。膜下或棚內(nèi)要保溫、防寒和防高溫。注意通風(fēng)降溫，一般膜下或棚內(nèi)溫度達(dá)到35℃并有繼續(xù)上升的趨勢(shì)時(shí)，煙苗易受傷害，應(yīng)及時(shí)揭膜，控制溫度。可采用斷水、揭膜和掐葉等措施進(jìn)行煉苗。移栽前7天，苗床不澆水，白天把塑料薄膜揭去，晚上蓋好，移栽前5天，不再蓋塑料薄膜。整個(gè)苗期掐葉或剪葉2～3次。

　　三、苗期蚜蟲(chóng)及斑潛蠅的隔離  育苗棚的門(mén)窗和周?chē)�通風(fēng)口用40目尼龍網(wǎng)覆蓋，以隔蟲(chóng)、防蟲(chóng)，普通苗床可采用40目拱架防蟲(chóng)網(wǎng)進(jìn)行覆蓋。這樣不僅徹底防止了苗期蚜蟲(chóng)及斑潛蠅的危害，而且大大降低了煙苗感染病毒的機(jī)率。

　　四、藥劑保護(hù)  要經(jīng)常噴藥防治苗床周?chē)�大棚和露地蔬菜上的蚜蟲(chóng)，尤其是在通風(fēng)排濕前，以減少進(jìn)入苗床的蚜蟲(chóng)數(shù)量，可用10％的吡蟲(chóng)啉3000倍液或50％的抗蚜威粉劑3000倍液進(jìn)行噴施防治。發(fā)現(xiàn)苗期炭疽病，可噴施50％的退菌特可濕性粉劑500倍液，每7～10天1次；立枯病可用70％的甲基托布津可濕性粉劑1000倍液進(jìn)行噴施防治，每7～10天1次，連噴2～3次；猝倒病可用25％的甲霜靈或58％的雷多米爾錳鋅500倍液噴施2～3次；噴藥的同時(shí)要及時(shí)剔除病苗。對(duì)于黑脛病發(fā)生較重的地方或較感病品種，移栽前2天用25％的甲霜靈成58％的雷多米爾錳鋅500倍液澆灌1次。苗期還應(yīng)重視噴施抗病毒劑預(yù)防病毒，苗期噴施1～2次，移栽前1天噴施1次，以防止病毒在移栽時(shí)通過(guò)接觸傳染。目前煙草生產(chǎn)上推廣應(yīng)用的抗病毒劑種類(lèi)較多，如金葉寶、菌克毒克、病毒必克、植物生理平衡劑、植病靈等，效果都較好，可根據(jù)當(dāng)?shù)貙?shí)際情況選用。