硝化細(xì)菌 nitrifying bacteria 好氧的氧化氨為亞硝酸（亞硝酸細(xì)菌）和氧化亞硝酸為硝酸（硝酸細(xì)菌）的一群土壤細(xì)菌。它們?nèi)魏螘r(shí)候都是進(jìn)行生態(tài)學(xué)的相伴生活；在營(yíng)養(yǎng)方面是化學(xué)合成無(wú)機(jī)氧化的無(wú)機(jī)營(yíng)養(yǎng)細(xì)菌。二者均為革蘭氏陰性細(xì)菌。以下列反應(yīng)獲得能量同化CO₂（CO₂＋H₂O→1/6C₆H₁₂O₁₈，△G=118千卡）：

　　在硝化細(xì)菌的細(xì)胞內(nèi)有的具有如光合細(xì)菌取樣的發(fā)達(dá)的層狀結(jié)構(gòu)，其中局部具有氧化無(wú)機(jī)物的細(xì)胞色素電子傳遞系統(tǒng)，與其共軛產(chǎn)生以ATP為代表的化學(xué)能；其中一部分因形成來(lái)自細(xì)胞色素系統(tǒng)的反向電子流而被消耗，而細(xì)胞色素系統(tǒng)是固定和同化二氧化碳所必需的還原能力（NADH或NADPH）這個(gè)機(jī)制是受細(xì)胞的無(wú)機(jī)營(yíng)養(yǎng)生活密切的控制。氧化有機(jī)物的生物即使從外部供給作為能源的有機(jī)物也不能利用，表現(xiàn)它是好氧生活的一種極端的生物。pH8以上的堿性條件尤為合適，對(duì)NH₄ 、NO₂^-等具有嚴(yán)格的特異性。土壤的硝化率為每克土壤每天氧化0.02毫克的銨態(tài)氮，這相當(dāng)于每公頃每天1／4—1／2噸的硫酸銨。特別是硝化細(xì)菌其附著于土壤顆粒表面的性質(zhì)受到重視。在土壤細(xì)菌區(qū)系中對(duì)其氮素代謝大力地進(jìn)行研究著。