胚胎發(fā)育過程中與細(xì)胞分化同時進行的塑造胚體體形和內(nèi)部特有的組織、器官的構(gòu)型的過程。胚胎細(xì)胞的最初形態(tài)是一致的，在發(fā)育過程中經(jīng)歷了化學(xué)分化、組織分化和增長分化三個階段，從而逐漸出現(xiàn)了特有的細(xì)胞、組織、器官形態(tài)和功能特征。盡管不同的有機體的形態(tài)發(fā)生過程形式有所區(qū)別，但形態(tài)發(fā)生的方式是大同小異的，都是以細(xì)胞為基礎(chǔ)。在個體發(fā)育中，通過復(fù)雜的細(xì)胞活動，包括細(xì)胞遷移、細(xì)胞變形、細(xì)胞識別、細(xì)胞粘著、細(xì)胞集結(jié)團聚、細(xì)胞層的內(nèi)卷、外突和復(fù)褶等。

　　細(xì)胞的遷移 指細(xì)胞或細(xì)胞群由一個區(qū)域定向、準(zhǔn)確地遷到最終位置，是組織形成和器官發(fā)生過程中的重要運動方式之一。常見的有原始生殖細(xì)胞從卵黃囊遷移到生殖嵴；神經(jīng)管附近的神經(jīng)嵴細(xì)胞從原來的背中線位置遷移到有機體的不同部位并形成神經(jīng)節(jié)、腎上腺髓質(zhì)、色素細(xì)胞等。

　　細(xì)胞變形 最明顯的例子是兩棲類早期發(fā)育過程中外胚層細(xì)胞的變化。當(dāng)原腸形成時，在外胚層細(xì)胞外包運動中，細(xì)胞變扁、變薄；當(dāng)神經(jīng)外胚層形成神經(jīng)板時，細(xì)胞伸長成高柱狀，形成厚的神經(jīng)板；以后由于神經(jīng)板細(xì)胞表層的不同程度收縮而產(chǎn)生神經(jīng)褶，進而形成神經(jīng)管。兩棲類原腸形成時，其預(yù)定內(nèi)胚層細(xì)胞經(jīng)內(nèi)陷作用而形成瓶狀細(xì)胞。細(xì)胞變形一般伴隨著細(xì)胞遷徙。許多實驗表明這兩種細(xì)胞運動方式都與微管、微絲有關(guān)。細(xì)胞的伸長和微管有關(guān)，而細(xì)胞的收縮和微絲有關(guān)。

　　細(xì)胞識別和細(xì)胞粘著 細(xì)胞識別和細(xì)胞粘著在發(fā)育過程中有著極其重要的作用。不同的胚胎細(xì)胞通過遷移、識別而特異地粘著以形成特異的組織和器官原基。細(xì)胞識別與粘著具有種屬特異性與組織特異性，而組織特異性往往比種屬特異性更強。采用經(jīng)典的對海綿細(xì)胞“檢出”的方法以及放射標(biāo)記細(xì)胞后與未標(biāo)記的細(xì)胞團混合培養(yǎng)，可證明細(xì)胞識別的種屬特異性和組織特異性。

　　細(xì)胞的內(nèi)卷、外突和復(fù)褶 細(xì)胞由表層卷到內(nèi)層、由原有位置下凹或外突而形成褶襞。例如神經(jīng)管、腺體、牙、毛、眼囊、咽囊、肢芽等胚基的形成。

　　細(xì)胞的分層和集結(jié) 胚胎早期胚層的分離，大、小腦皮質(zhì)和消化管壁的細(xì)胞層的形成都屬細(xì)胞分層方式。軀體的體節(jié)結(jié)構(gòu)，如體節(jié)、脊椎骨、神經(jīng)節(jié)、神經(jīng)核團等是通過細(xì)胞的集結(jié)團聚形成。