體外轉(zhuǎn)錄合成siRNAs,其成本相對化學合成法比較低,是一種相對性價比高的篩選siRNAs的好方法,而且要比化學合成法更快的得到siRNAs。一旦得到DNA 雙鏈模版(這個還是需要DNA合成的,不過DNA合成的成本就比較低了),只要24小時轉(zhuǎn)染,不需要等很久。在體外構建雙鏈RNA時,分別在體外轉(zhuǎn)錄出正義和反義RNA,再將兩者退火,形成雙鏈RNA。體外合成的雙鏈RNA可以用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)入細胞中。但有些細胞脂質(zhì)體轉(zhuǎn)移效果差,轉(zhuǎn)移到細胞內(nèi)的雙鏈RNA半衰期短。
這個方法的不足之處是實驗的規(guī)模受到限制,雖然一次體外轉(zhuǎn)錄合成能提供足夠做數(shù)百次轉(zhuǎn)染的siRNAs,但是反應規(guī)模和數(shù)量始終有一定的限制。而且和化學合成相比,還是需要占用研究人員相當?shù)臅r間——化學合成只需要定購就可以了。但體外轉(zhuǎn)錄得到的siRNAs只要較低的濃度就可以達到化學合成siRNAs較高濃度得到的效果。
適用:篩選siRNAs,特別是需要制備多種siRNAs,試驗經(jīng)費受限時。
不適用:1.需要大量的某個特定的siRNA。2.進行長期研究。