纖毛動(dòng)力蛋白是一種多頭的蛋白。在電子顯微鏡下觀察，纖毛動(dòng)力蛋白像是具有2～3個(gè)頭的一束花，每一支花都是由一個(gè)大的球形結(jié)構(gòu)域和一個(gè)小的球形結(jié)構(gòu)域組成，中間通過一個(gè)小的桿部同基部相連。纖毛動(dòng)力蛋白的基部同A管相連，而頭部同相鄰的 B 管相連。 頭部具有ATP結(jié)合位點(diǎn)，能夠水解ATP。