已發(fā)現(xiàn)的病害有30余種，其中真菌性病害最多，病毒類(lèi)主要是大豆花葉病毒，線蟲(chóng)病主要為孢囊線蟲(chóng)和根結(jié)線蟲(chóng)。

大豆銹病、炭疽病、細(xì)菌性斑疹病等，在南方發(fā)生較重。北方春大豆區(qū)霜霉病、灰斑病、細(xì)菌性斑點(diǎn)病、孢囊線蟲(chóng)病發(fā)生普遍。大豆病毒病在各大豆栽培區(qū)都有發(fā)生。

為害大豆粒莢為主的有：紫斑病Cercospora kikuchii、輪紋病Ascochyta glycines、赤霉病Fusarium avenacearum(Fusarium roseum、Fusarium semitectum)、莢枯病Macrophoma mame、炭疽病Colletotrichum glycines、黑痘病Sphaceloma glycines。

葉部病害主要有：霜霉病Peronospora manshurica、灰斑病Cercospora sojina、褐紋病Septoria glycines、黑斑病Alternaria brassicae var.phaseoli Alternaria fasciculata Alernaria tenuissima、銹病Phakopsora pachyrhizi、白粉病Erysiphe polygoni、細(xì)菌性斑點(diǎn)病Pseudomonas glycinea、細(xì)菌性斑疹病Xanthomonas phaseoli var. sojense、大豆花葉病Soybean mosaic virus(SMV)等。

莖稈部病害有：菌核病Sclerotinia sclerotiorum、黑點(diǎn)病Phomopsis sojac(Diaporthe phaseolorum)、紋枯病Pellicularia sasakii。

根部病害有：立枯病Rhizoctonia solani、猝倒病Pythium debaryanum、枯萎病Fusarium bulbigenum (F.oxysporum)。

還有孢囊線蟲(chóng)Heterodera glycines主要發(fā)生在黑龍江、吉林、遼寧、內(nèi)蒙古、河北、山東、河南等省(自治區(qū))。根疫病Phytophthora magasperma var.sojae是美國(guó)的主要病害，中國(guó)尚未發(fā)現(xiàn)。是檢疫對(duì)象。

大豆病害的防治以抗病品種為主的綜合防治措施。藥劑防治：在30余種大豆病害中，由種子帶菌為初次侵染源的占60%左右，藥劑拌種能減少病害的侵染源，而且對(duì)苗期病害也有防治效果。如福美雙0.3%拌種，可防治大豆霜霉病和灰斑病。葉部病害如霜霉病、灰斑病，根部病害如孢囊線蟲(chóng)病等，均可用藥劑進(jìn)行有效防治；農(nóng)業(yè)措施防治，采取合理輪作，如防治大豆孢囊線蟲(chóng)病，實(shí)行大豆與禾谷類(lèi)作物或非寄生作物3-5年輪作，減少蟲(chóng)源。 種前通過(guò)選種，建立無(wú)病種子田，對(duì)防治霜霉病、紫斑病、灰斑病，大豆花葉病毒效果較好。中耕除草，排除田間積水，能減輕大豆觖病和根部病害的發(fā)生。增施有機(jī)肥，適時(shí)灌水，可減輕孢囊線蟲(chóng)病的為害。清除田間雜草，亦可減少大豆花葉病毒等病害。