1、超高壓處理要求非常特殊的設備，如桔子汁可能在壓力室內批處理，然后無菌灌裝預先消毒的包裝內。
2、超高壓加工必須考慮微生物的種類、產(chǎn)品特性、理想的過程（巴氏殺菌或商業(yè)消毒）和產(chǎn)品銷售方式。
3、超高壓處理對生長的細菌、酵母和霉菌是非常有效，但芽胞對高壓不會失活，而要另外加熱或其他一些作用以達殺死的高水平。