不同型號(hào)和生產(chǎn)廠商的熱循環(huán)儀可能會(huì)展現(xiàn)出不同的性能和可重復(fù)性。 這些不同不僅會(huì)影響PCR效率也會(huì)對(duì)獲取數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和一致性造成影響[1-3]。 過度使用的熱循環(huán)儀的可靠性，以及當(dāng)問題出現(xiàn)時(shí)可提供的支持，都是在進(jìn)行熱循環(huán)儀選擇時(shí)需要考慮的重要方面。 因此，了解可影響PCR結(jié)果的熱循環(huán)儀特點(diǎn)可幫助我們最大程度實(shí)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)的成功。

1. 加熱模塊之間準(zhǔn)確而一致的溫度

熱循環(huán)儀溫度的準(zhǔn)確性可能會(huì)對(duì)PCR的成敗與否起決定性作用，因?yàn)?/span>PCR的三個(gè)主要步驟都依賴于溫度。 類似地，加熱模塊上孔與孔之間的溫度一致性對(duì)于獲取可靠而可重復(fù)的PCR結(jié)果也是至關(guān)重要的。 因此，所使用的熱循環(huán)儀能在模塊之間準(zhǔn)確到達(dá)設(shè)定的溫度并具有一致性十分關(guān)鍵。
確保熱準(zhǔn)確性的一種方法就是經(jīng)常使用溫度驗(yàn)證試劑盒進(jìn)行檢測(cè)并根據(jù)需要由接受過培訓(xùn)的專業(yè)人士進(jìn)行重新校準(zhǔn)。 溫度驗(yàn)證檢測(cè)通�？捎糜冢涸诘葴啬Ｊ较孪鄬�(duì)于設(shè)定溫度的孔間準(zhǔn)確性、在溫度轉(zhuǎn)換后相對(duì)于設(shè)定溫度的孔間準(zhǔn)確性、熱蓋溫度的準(zhǔn)確性（可影響模塊和樣品溫度）

2. 用于引物退火優(yōu)化的精確溫度控制
梯度溫度控制是熱循環(huán)儀一項(xiàng)可有助于PCR中引物退火優(yōu)化的功能。 梯度設(shè)定的目的是在模塊之間實(shí)現(xiàn)變化的溫度，通過每列之間≥2°C的間隔溫度升降，使得可同時(shí)對(duì)于一系列的溫度進(jìn)行測(cè)試以獲取最佳的引物退火溫度。
理論上，真正的梯度可在模塊之間實(shí)現(xiàn)線性的溫度。 然而，梯度熱循環(huán)儀通常只采用單一的熱模塊并通過位于兩端的兩個(gè)加熱及冷卻元件進(jìn)行溫度的控制。 該設(shè)計(jì)經(jīng)常會(huì)導(dǎo)致以下限制[5]：
· 僅能設(shè)置兩個(gè)溫度：在熱模塊的兩端設(shè)置成引物退火的高、低極限溫度。 因此，無法在模塊間實(shí)現(xiàn)其他溫度的精準(zhǔn)設(shè)置。
· 由于不同列之間的熱交換，模塊上不同區(qū)域之間的溫度更可能遵循的是S形的曲線變化而非真正的線性梯度。
具有“better-than-gradient”技術(shù)的熱循環(huán)儀可實(shí)現(xiàn)更好的引物退火溫度控制[5]。 該技術(shù)的一種形式便是設(shè)計(jì)帶有三個(gè)或更多分割金屬模塊的熱循環(huán)儀，每一模塊都具有獨(dú)立的加熱和冷卻元件。 相比于梯度模塊，該模塊設(shè)計(jì)可帶來：
· 獨(dú)立設(shè)置三種或更多不同溫度的能力，以便使得每個(gè)獨(dú)立的區(qū)域都能進(jìn)行更好的溫度控制，特別是在優(yōu)化過程中。
· 獨(dú)立金屬模塊的絕熱性阻止了模塊之間的熱交換。 這就可實(shí)現(xiàn)更為精準(zhǔn)的模塊溫度控制，確保模塊之間實(shí)現(xiàn)真正線性的溫度變化。

3. 獲得準(zhǔn)確的樣品溫度： 升降溫速度，維持時(shí)間及算法
熱循環(huán)儀對(duì)于樣品溫度控制的能力對(duì)于PCR檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性和整體性能十分重要。 儀器特異性的參數(shù)如升降溫速度，維持時(shí)間以及算法對(duì)于預(yù)測(cè)樣品溫度（包括模塊溫度都是準(zhǔn)確控制樣品溫度的關(guān)鍵[6]。
熱循環(huán)儀的升降溫速度意味著在一定時(shí)間內(nèi)發(fā)生的PCR步驟之間的溫度變化，并通過用攝氏度每秒(°C/sec)作為單位。 相應(yīng)的“升溫”和“降溫”分別代表著熱模塊的加熱和冷卻過程。
由于熱量從模塊傳輸至樣品需要一定的時(shí)間，樣品實(shí)際的升降溫速度會(huì)較慢（相對(duì)于模塊）。 因此，對(duì)于變溫速度的定義需要進(jìn)行區(qū)分和了解。
· 最大或峰值模塊升降溫速度代表在進(jìn)行升降溫過程中非常小的一段時(shí)間內(nèi)模塊可以達(dá)到的最快溫度變化。
· 平均模塊升降溫速度代表在一段更長(zhǎng)的時(shí)間內(nèi)溫度變化的速度，對(duì)于熱循環(huán)儀的速度會(huì)提供一種更具代表性的測(cè)量。
· 最大樣品升降溫速度及平均樣品升降溫速度反映的是樣品實(shí)際獲得的溫度。 因此，樣品升降溫速度會(huì)為熱循環(huán)儀的性能以及其對(duì)于PCR結(jié)果的潛在影響提供一種更為準(zhǔn)確的比較。
由于熱循環(huán)儀的升降溫速度會(huì)對(duì)PCR結(jié)果產(chǎn)生影響，當(dāng)進(jìn)行熱循環(huán)儀更換時(shí)，推薦使用帶有可模擬之前模式升降溫速度程序的儀器以實(shí)現(xiàn)更為簡(jiǎn)易的更換并對(duì)PCR的重復(fù)性產(chǎn)生最小的影響。

4. 滿足不同實(shí)驗(yàn)通量的靈活性及設(shè)計(jì)
在一定時(shí)間內(nèi)可以在熱循環(huán)儀內(nèi)進(jìn)行的反應(yīng)數(shù)對(duì)于PCR實(shí)驗(yàn)的效率十分重要。 可提升熱循環(huán)儀通量的因素包括升降溫速度、熱模塊構(gòu)造以及自動(dòng)化平臺(tái)的整合。
熱循環(huán)儀的升降溫速度代表了其達(dá)到設(shè)置溫度的速度。 升降溫速度越快，PCR運(yùn)行的速度就會(huì)越快，也就是在一定時(shí)間內(nèi)可以完成更多的實(shí)驗(yàn)。 此外，使用可更快合成目標(biāo)DNA的DNA聚合酶也可對(duì)高通量實(shí)驗(yàn)進(jìn)行加速[7]。
熱循環(huán)儀模塊的設(shè)計(jì)對(duì)于PCR實(shí)驗(yàn)的設(shè)置也至關(guān)重要。 例如，可替換的模塊就可為每輪運(yùn)行帶來樣品數(shù)量上的靈活性。 此外，具有可單獨(dú)控制的多個(gè)模塊的加熱模塊是在一臺(tái)熱循環(huán)儀上同時(shí)運(yùn)行不同PCR程序的理想選擇。
對(duì)于自動(dòng)化的高通量PCR，熱循環(huán)儀應(yīng)該可編程并兼容控制移液處理系統(tǒng)的軟件。 自動(dòng)化系統(tǒng)是進(jìn)行高通量PCR反應(yīng)的理想選擇，因?yàn)槠淇梢栽趲缀鯖]有人為干預(yù)的情況下持續(xù)不斷地運(yùn)行，因而將手工實(shí)驗(yàn)設(shè)置所需的時(shí)間最小化，并提高在一定時(shí)間內(nèi)可反應(yīng)的數(shù)量。 因此，對(duì)于比較簡(jiǎn)易而靈活的自動(dòng)化平臺(tái)進(jìn)行整合的需求是存在的，從而實(shí)現(xiàn)移液處理或板堆疊的完全自動(dòng)化操作。
最后，當(dāng)使用一組熱循環(huán)儀時(shí)，通過云端或on-premise服務(wù)器對(duì)于儀器進(jìn)行遠(yuǎn)程控制，是相對(duì)于菊花式（“daisy chain”）有線連接更為便捷并有需求的連接方式。

5. 熱循環(huán)儀的可靠性，耐久性及質(zhì)量保證
除了性能和通量能力外，熱循環(huán)儀也應(yīng)當(dāng)能夠承受一定的重復(fù)使用、環(huán)境壓力以及運(yùn)輸條件。 一些生產(chǎn)廠商可能會(huì)對(duì)儀器如何進(jìn)行可靠性和耐久性的檢測(cè)進(jìn)行過報(bào)道[8]。 相應(yīng)的熱循環(huán)儀檢測(cè)包括：
· 組件可靠性： 機(jī)械裝備會(huì)被用于對(duì)經(jīng)常使用的儀器組件如熱蓋、控制面板/觸摸屏以及溫度循環(huán)模塊進(jìn)行重復(fù)的測(cè)試。
· 環(huán)境壓力： 可使用環(huán)境艙來模擬常規(guī)實(shí)驗(yàn)的不同條件，如溫度、濕度以及海拔（圖7B）。
· 運(yùn)輸檢測(cè)： 可根據(jù)國(guó)際安全運(yùn)輸協(xié)會(huì)（ISTA)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行激烈的沖擊和振動(dòng)檢測(cè)，以確保儀器可在無受損的工作條件下運(yùn)達(dá)。

6. 維護(hù)熱循環(huán)儀的質(zhì)保和服務(wù)
盡管有嚴(yán)格的可靠性和耐久性測(cè)試，熱循環(huán)儀在儀器的使用壽命周期內(nèi)仍然不可避免地會(huì)存在技術(shù)性問題。為了消除后顧之憂，在進(jìn)行購(gòu)買儀器時(shí)應(yīng)該考慮由生產(chǎn)廠商所提供的質(zhì)保、服務(wù)和維護(hù)。 需了解：
· 服務(wù)的靈活性如上門/返廠維修，遠(yuǎn)程監(jiān)控服務(wù)，維修過程中的替代儀器等，來最大降低對(duì)于工作效率的影響。
· 質(zhì)保期的長(zhǎng)短，服務(wù)的周轉(zhuǎn)時(shí)間，技術(shù)支持的可接觸度，以及專業(yè)支持人員的技能和知識(shí)。
· 儀器安裝、操作、合作、驗(yàn)證的可行性來滿足實(shí)驗(yàn)室和相關(guān)規(guī)定的要求
· 可獲取如溫度驗(yàn)證、檢測(cè)、校準(zhǔn)和清洗的維護(hù)服務(wù)以確保儀器正常發(fā)揮相應(yīng)的參數(shù)性能
總之，熱循環(huán)儀的特點(diǎn)如性能、設(shè)計(jì)、可靠性以及可獲得的支持和服務(wù)，是選擇PCR儀器需要考慮的重要因素。

參考文獻(xiàn)

1. Thermo Fisher Scientific Inc. (2015) 熱循環(huán)儀溫度準(zhǔn)確性：不同型號(hào)間的比較。 （應(yīng)用資料）

2. Thermo Fisher Scientific Inc. (2015) 熱循環(huán)儀擴(kuò)增的穩(wěn)健性：不同型號(hào)間的比較。 （應(yīng)用資料）

3. Thermo Fisher Scientific Inc. (2015) 熱循環(huán)儀樣品擴(kuò)增的均一性：不同型號(hào)間的比較。 （應(yīng)用資料）

4. Kim YH, Yang I, Bae YS等。 (2008) 快速PCR循環(huán)條件下熱循環(huán)儀的性能評(píng)估。 Biotechniques 44:4. 495–505.

5. Thermo Fisher Scientific Inc. (2017) VeriFlex熱循環(huán)溫度控制技術(shù) （應(yīng)用資料）

6. Thermo Fisher Scientific Inc. (2015) 熱循環(huán)儀：熱循環(huán)關(guān)鍵概念和升降度速率。 （應(yīng)用資料）

7. Thermo Fisher Scientific Inc. (2018) 用于高通量PCR的Platinum II Taq Hot-Start DNA 聚合酶。 （應(yīng)用資料）

8. Thermo Fisher Scientific Inc. (2015) Applied Biosystems熱循環(huán)儀：可靠性及質(zhì)量檢測(cè)。 （應(yīng)用資料）